提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
【我们这十年@坐标中国】坐标上的“跨度”，让梦想照进现实******
中新网9月17日电 题：坐标上的“跨度”，让梦想照进现实
张尼 葛成
“我们在国际上首次实现了在空间对太阳Hα波段的光谱扫描成像……”2022年8月底，“羲和”探日成果正式发布，它不负众望，实现了多项国际首次。
回首这十年，从跨海大桥到环沙漠铁路，从公路横穿天山到跨越琼州海峡输电，从“嫦娥”探月到“羲和”逐日……中国坐标编织经纬，跨越高山、大海、沙漠，甚至向遥远的外太空进发。上九天揽月、下五洋探海，14亿人的梦想一次次照进现实。
梦想成真，离不开攻坚克难的恒心。
曾几何时，国际天文学联合会先后以1333个科学家的名字命名月球上的环形山。其中，只有7位中国人的名字，古代5位，现代只有2位……什么时候中国人也能带回一片“自己的月亮”？
2004年中国探月工程立项，自此“一张蓝图绘到底”，中国航天人夜以继日开展技术攻关，终于在2020年12月，嫦娥五号从月球带回约2公斤月壤。
这些年，中国人向着月球、火星、太阳等星球不断进发，叩问苍穹的脚步不曾停歇，远古神话梦想一个个变成现实。
梦想成真，离不开敢啃“硬骨头”的决心。
茫茫荒漠、漫漫黄沙，在“生命禁区”连通一条铁路，难于上青天。中国人能做到吗？
解决风沙防护问题，克服恶劣自然条件，为了让和若铁路早日通车，施工高峰期建设者放弃与家人团聚的机会，在零下20℃的严寒里坚守岗位……最终，和若铁路补齐了世界首条环沙漠铁路最后一段“弧线”，而从铁路开工建设到正式通车仅用时三年多。
梦想成真，离不开全国人民的万众一心。
在跨越琼州海峡的联网工程中，为了按时将海缆从临时泵站转移到终端站，100多名村民，经过多次演练，靠着肩挑背扛的人海战术成功搬运了海缆，令外方都大加赞叹。也正是有了这样的凝聚力，才能让一个个“不可能完成的任务”顺利执行。
一条条铁路公路电路贯通，背后连接着的是14亿中国老百姓的小日子。
中国在坐标上实现的跨度，绝不仅仅是空间距离的突破，更承载着一个国家、民族飞越沧海的历史。(完)
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